|
|
 |
|
|
|
|
|
|
| Detalji |
| Projekt: |
Dinamika kromatina i plastičnost genoma |
| Voditelj: |
Vlatka Zoldoš Pečnik |
| Ustanova: |
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb |
| Sažetak: |
Eukariotske stanice osjetljive su na različite vanjske signale koji aktiviraju unutarstanične signalne puteve mijenjajući na taj način ekspresiju gena. Dinamična i pažljivo regulirana struktura kromatina modulira interakcije molekule DNA s proteinima koji sudjeluju u životno važnim procesima eukariotske jezgre kao što su replikacija, transkripcija, rekombinacija i popravak DNA. Promjene strukture kromatina kroz metilaciju DNA, post-translacijske modifikacije histona te nukleosomno remodeliranje predstavljaju epigenetičku informaciju koja je uključena je u regulaciju ekspresije gena, a s kojom su povezane mnoge biološke funkcije eukariotske stanice. Nedavno je pokazano da se različite epigenetički regulirane forme istoga gena, epialeli, mogu formirati kao odgovor na stres u okolišu te dovesti do pojave novih fenotipova. Biljni organizmi se na taj način relativno brzo adaptiraju na nove uvjete bez promjene genetičke informacije što pridonosi plastičnosti njihovih genoma. Epialeli pridonose nasljednoj varijabilnosti te stoga imaju učinak na mikroevoluciju. Osnovni cilj projekta je pridonijeti razumijevanju epigenetičkih zakonitosti uključenih u regulaciju funkcioniranja biljnoga genoma i njegove prilagodbe na nepovoljne okolišne čimbenike. Predloženim istraživanjima želimo odgovoriti na pitanje važnosti epialela u odgovoru biljnih genoma na okolišni stres, te pridonijeti razumijevanju regulacije ekspresije gena, kroz modifikacije i modulacije kromatina, te nasljeđivanja epigenetičke informacije. rRNA geni poslužit će kao modelno genomsko područje zbog nekoliko pogodnosti: (i) dolaze u prekomjernom broju od kojeg je samo određena porcija transkripcijski aktivna, (ii) regulacija transkripcijske aktivnosti kontrolirana je na razini kromatina, (iii) zbog svoje ponavljajuće strukture podložni su metilaciji te predstavljaju idealne kandidate za istraživanje epialela. Projektom ćemo identificirati nukleotidne sljedove rDNA podložne epigenetičkim modifikacijama, te barem djelomično odgovoriti na koji su način različite epigenetičke modifikacije povezane s modulacijom transkripcijske aktivnosti u procesu utišavanja rRNA gena. Dešifriranje ekspresije rRNA gena, koji su visoko konzervirani između biljaka i životinja do čovjeka, u jednom modelnom organizmu predstavlja dobru bazu za istraživanja i na drugim organizmima, a epigenetičke zakonitosti pronađene u ovom modelnom sustavu zasigurno će poboljšati razumijevanje epigenetičkih zakonitosti i mehanizama općenito. |
|
|
|
|
|
|
|
