|
|
 |
|
|
|
|
|
|
| Detalji |
| Projekt: |
Spektroskopija NMR i modeliranje bioaktivnih molekula |
| Voditelj: |
Dejan Plavšić |
| Ustanova: |
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb |
| Sažetak: |
U okviru predloženog projekta istraživat će se struktura, dinamika i interakcije peptida, njihovih fragmenata odgovornih za bioaktivnost, njihovih konjugata s DNK i RNK, bioorganskih molekula s aromatskim prstenom, kompleksa s prijelaznim metalima, te drugih bioaktivnih molekula, korištenjem spektroskopije NMR i metoda molekulske mehanike, kvantne kemije i diskretne matematike. Izračunati parametri NMR (kemijski pomaci, sprege spin-spin) usporedit će se s eksperimentalnim podacima radi dobivanja što točnijeg uvida u strukturu istraživanih molekula i njihove interakcije s drugim molekulama u otopinama. Mjerenjem NOE interakcija, izotopnim obilježavanjem i kompleksiranjem utvrdit će se konformacije istraživanih molekula bitne za njihovu bioaktivnost. Konstruirat će se grafičke reprezentacije DNK i proteina koje omogućuju laku vizualnu analizu sličnosti sekvenci DNK i proteina, a ujedno služe i kao osnova za nove numeričke karakterizacije njihovih struktura. Molekulskoj strukturi pridružit će se nove matrice iz kojih će se izvesti novi molekulski opisivači, koji se mogu upotrijebiti za razvijanje QSAR modela koji daju točnije procjene fizičkih i kemijskih svojstava kao i bioaktivnosti molekula. Dobivene spoznaje o strukturi, konformaciji i svojstvima bioaktivnih molekula moći će se iskoristiti za izučavanje biološki važnih procesa strukturiranja proteina, izomerizacije, interakcije između liganda i receptora, vodikove veze te farmakokinetike i dizajniranja lijekova. Predložena istraživanja su interdisciplinarna i stoga će doprinijeti povećanju znanja ne samo u kemiji nego i u drugim područjima. Dobiveni rezultati će biti objavljeni u uglednim međunarodnim znanstvenim časopisima. |
|
|
|
|
|
|
|
