|
|
 |
|
|
|
|
|
|
| Detalji |
| Projekt: |
Organizacija, funkcija i mehanizmi evolucije biljnog genoma |
| Voditelj: |
Višnja Besendorfer |
| Ustanova: |
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb |
| Sažetak: |
Sekvenciranje i mogućnost fizičkog kartiranja multigenskih porodica i ponavljajućih DNA slijedova predstavljaju značajan doprinos razumijevanju organizacije i evolucije biljnih genoma posebice u vrsta koje imaju velike genome koje je teško u cijelosti sekvencirati kao što su primjerice neke agronomski važne kulture i četinjače. Ponavljajući DNA slijedovi, koji mogu obuhvaćati i više od 90% biljnog genoma, smješteni su na točno određenim mjestima u kromosomu ili raspršeni po čitavom genomu. Pokretni genetički elementi, koji čine glavninu raspršene ponavljajuće DNA u biljaka, uzrokuju promjene u veličini i strukturi genoma, bilo izravno svojim premještanjem i umnažanjem, ili kao supstrat za ektopičnu homolognu rekombinaciju. Cilj istraživanja je usporednom analizom genoma na kromosomskoj i molekularnoj razini (distribucija i količina ponavljajućih nekodirajućih DNA sljedova, posebice pokretnih genetičkih elemenata) utvrditi evolucijske događaje uključene u adaptivnu specijaciju vrsta rodova Anemone, Polystachya, Abies, Iris i Ocimum, kao predstavnika prirodnih populacija i kultivara. Također, utvrdit će se mogućnost primjene endogenih retrotranspozona u svrhu analize među- i unutarvrsne raznolikosti. Isto tako, istražit će se mogućnost primjene aktivnih retrotranspozona u svrhu ciljane inaktivacije željenih gena radi utvrđivanja njihove funkcije u biljnom genomu, jer jedino u biljaka još nije razvijena rutinska metoda za ugradnju željenih fragmenata DNA (gena) na unaprijed odabrana mjesta genoma («gene targeting»). Metoda koja je od iznimne važnosti, kako u svakodnevnoj istraživačkoj praksi tako i u oplemenjivanju poljoprivrednih kultura. U tom kontekstu istražit će se uvjeti kojima se može povećati učestalost homologne rekombinacije u somatskim stanicama biljaka i uzroke uočenoj nestabilnosti nekih retrotranspozona u bakteriji A. tumefaciens koja je nezaobilazno oruđe u biljnom genetičkom inženjerstvu. Također, cilj projekta je proširiti istraživanja mehanizma homologne rekombinacije na različitim fenomenima u bakteriji E. coli kao modelnom organizmu s ciljem da nam pomognu u razumijevanju regulacije stabilnosti i promjenljivosti genoma općenito. U okviru toga istražit će se mehanizmi regulacije zaštite vlastitog bakterijskog kromosoma od napada strane DNA. |
|
|
|
|
|
|
|
