|
|
|
|
|
|
Detalji |
Projekt: |
Diferencijalna ekspresija proteina u biljnim stanicama |
Voditelj: |
Marijana Krsnik-Rasol |
Ustanova: |
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb |
Sažetak: |
U predloženom projektu polazimo od pretpostavke da će istraživanje proteoma dati dio odgovora na temeljna pitanja iz razvojne biologije biljaka, kao što su: stanična diferencijacija, dediferencijacija, tumorska transformacija, oblikovanje tkiva i organa (morfogeneza). Istraživat ćemo tri in vitro sustava koji se uzgajaju u kontroliranim uvjetima te predstavljaju pogodne modele, a to su: transformirani kalus šećerne repe (Beta vulgaris L.), tumor i teratom hrena (Armoracia lapathifolia Gilib.) te prilagođeno i tumorsko tkivo kaktusa (Mammillaria gracillis Pfeiff). Razvojno specifični proteini otkrit će se tehnikama 1-D i 2-D elektroforeze, a za njihovu identifikaciju primijenit će se masena spektrometrija. Koristeći HPLC i masenu spektrometriju MALDI, pratit će se promjene u N-glikozilaciji tijekom diferencijacije stanica i morfogeneze tkiva. Utvrdit će se razvojno specifični izoenzimi peroksidaze, esteraze i mirozinaze te njihova subcelularna lokalizacija. Razvojno specifični proteinski i glikoproteinski biljezi lokalizirat će se u straničnim kompartimentima imuno-mikroskopskim tehnikama. Radi objektivnije i pouzdanije interpretacije proteinskih profila primijenit će se računalna obrada slike i strojno učenje. Dobiveni rezultati dat će neke odgovore na temeljna pitanja iz razvojne biologije biljaka, a također i na mogućnost primjene kulture biljnih stanica i tkiva u biotehnološke svrhe i to za: (i) sintezu složenih N-glikana s dvostrukim antenama, (ii) ugradnju sijalinske kiseline u oligosaharide glikoproteina, što je ključno za proizvodnju ljudskih proteina heterolognom ekspresijom u biljnim stanicama, (iii) sintezu crvenog pigmenta – betalaina u transformiranoj staničnoj liniji šećerne repe te glukozinolata u tumoru i teratomu hrena. |
|
|
|
|
|
|