|
|
 |
|
|
|
|
|
|
| Detalji |
| Projekt: |
Modeliranje bioaktivnih molekula i ispitivanje njihovih svojstava i učinka |
| Voditelj: |
Nikola Štambuk |
| Ustanova: |
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb |
| Sažetak: |
Proteini i njihove podjedinice peptidi, upravljaju životnim procesima u organizmu. Nove spoznaje u molekularnoj biologiji, te napredak peptidne biokemije uzrokovao je rastuće zanimanje za oblikovanje i analizu bioaktivnih peptida. Ciljanim odabirom i modeliranjem peptidnih motiva moguće je prirediti te razvijati novu generaciju selektivnih imunomodulatora. U slučaju nedostatne imunogenosti cjepiva, antigeni motiv se može inokulirati s adjuvansima temeljenim na uljima ili prezentacijom u obliku imunokompleksa. Odabirom odgovarajućih adjuvansa mogu se prirediti stabilne emulzije jednostavne za primjenu i koje ne izazivaju neželjene popratne pojave. Cilj istraživanja je optimizirati računarske algoritme i metode molekularnog modeliranja pojedinih proteinskih molekula tako da se definiraju bioaktivni motivi i njihovi ligandi. Istraživanje bi trebalo rezultirati spoznajom kako je moguće modelirati i eksperimentalno verificirati epitop-paratop odnosno ligand-receptor interakcije pojedinih peptida. Koristiti će se algoritami zasnovani na fizikalno kemijskim pokazateljima svojstava amino kiselina i teoriji molekularnog prepoznavanja. Nakon modeliranja peptida izvršiti će se provjera ligand-receptor interakcija spektroskopskim metodama, te in vitro i in vivo pokusima. Pri evaluaciji rezultata korist će se i suvremene metode bioinformatike i biostatistike zasnovane na mašinskom učenju, neuronskim mrežama i klasifikacijskim stablima. Sustavno modeliranje svojstava i učinaka promatranih peptida, doprinijet će temeljnim spoznajama biomedicine, biokemije, molekularne biologije i bioinformatike. Racionalnim oblikovanjem peptidnih motiva biti će moguće prirediti novu generaciju bioaktivnih motiva, markera, nosača i cjepiva koja se mogu koristiti za dijagnostiku, terapiju i prognostiku autoimunih, malignih i degenerativnih bolesti. Spomenutom metodologijom smanjiti će se i potreba za eksperimentalnim testiranjem bioaktivnosti proteina te postići značajna ušteda u radu i materijalu. |
|
|
|
|
|
|
|
