|
|
 |
|
|
|
|
|
|
| Detalji |
| Projekt: |
Deterministički i probabilistički modeli u biologiji |
| Voditelj: |
Miljenko Marušić |
| Ustanova: |
Prirodoslovno-matematički fakultet, Matematički odjel, Zagreb |
| Sažetak: |
Matematičko modeliranje bioloških fenomena jedno je od najvažnijih područja primijenjene matematike. Suvremeni dosezi u teorijskoj i eksperimentalnoj biologiji proizvode sve veće količine podataka, te čine matematičko modeliranje bioloških fenomena sve realističnijim i važnijim. Cilj je ovog projekta razviti nove metode za modeliranje bioloških fenomena. Modeli koji će se promatrati biti će deterministički, bazirani prvenstveno na diferencijalnim jednadžbama, ili probabilistički. Tipično, biološki procesi, poput staničnog rasta, rasta tumora, i slično, bit će modelirani deterministički, dok će se za analizu bioloških nizova (DNA, RNA, proteini) koristiti probabilistički modeli.
Osnovne tehnike koje će se koristiti uključuju - za determinističke modele - numeričko rješavanje diferencijalnih jednadžbi, dok će se za analizu proteinskih nizova promatrati metode filogenetske rekonstrukcije, te konstrukcije i analize višestrukog poravnanja. Poseban naglasak će biti na razvoju hibridnih metoda, koje će na konzistentan način inkorporirati razne aspekte ekspertnog znanja u već postojeće modele. Takvi će modeli biti primijenjeni na razne probleme vezane za analizu bioloških nizova, na primjer, za dobivanje funkcionalne podjele proteinske familije, za prepoznavanje tercijarne strukture proteina, te modeliranje interakcija (protein-protein, ili protein-DNA) pomoću preklapanja profila familija. Statistička analiza i procjena parametara je naravno od ključne vaznosti u primjeni gore navedenih modela. Metode procjene, kao i metode statističkog testiranja hipoteza su jedan od aspekata kojima se namjeravamo baviti. Ovaj aspekt našeg istraživanja nalazi primjenu ne samo u kontekstu analize bioloških sekvenci, već i u mapiranju QTL-ova, i drugdje. |
|
|
|
|
|
|
|
